但目前三代试管婴儿存在一定的局限性，比如适用于单基因遗传病、染色体结构异常、染色体非整倍体等情况，针对一些尚未明确致病基因的遗传性疾病，或多基因遗传病(精神分裂症、高血压)等，则不能对其进行有效的筛查和诊断。目前第三代试管还不能筛查多基因遗。
基因有问题是可以通过三代试管婴儿，选择健康的胚胎移植，从而达到优生的几率。但目前三代试管婴儿存在一定的局限性，比如适用于单基因遗传病、染色体结构异常、染色体非整倍体等情况，针对一些尚未明确致病基因的遗传性疾病，或多基因遗传病(精神分裂症、高血压)等，则不能对其进行有效的筛查和诊断。
三代试管能否避免所有不良基因
第三代试管婴儿的技术也称胚胎植入前遗传学诊断/筛查，指在IVF-ET的胚胎移植前，取胚胎的遗传物质进行分析，诊断是否有异常，筛选健康胚胎移植，防止遗传病传递的方法。而第三代试管婴儿技术主要利用PGD和PGS，来筛查胚胎染色体是否正常和是否携带遗传病。
1、PGD指基因诊断技术，就是筛查养囊后的胚胎患有遗传病几率高低，如血友病、地中海贫血等;
2、PGS主要是基因筛查技术，看看胚胎是否有染色体方面的疾病，如21三体综合征、18三体综合征的风险高低。
不过要注意的是，目前全世界现有4000多种遗传病，而第三代试管婴儿技术，目前只能筛查出100多种，所以三代试管并不能完全阻断夫妻两的不良基因遗传给下一代。
解析三代试管婴儿的适用情况
通常来说，遗传疾病分为单基因遗传疾病、多基因遗传疾病和染色体遗传疾病。目前第三代试管还不能筛查多基因遗传疾病，只能筛查单基因遗传疾病和染色体异常疾病。具体如下所示：
1、单基因疾病
单基因遗传病是指由一对等位基因发生突变所引起的疾病，呈明显的孟德尔式遗传，一旦患上，终生无法治愈，并且有遗传给下一代的风险。单基因遗传病有很严格的遗传规律，几乎不受外因的影响。如地中海贫血，血友病，肌营养不良等遗传疾病。
2、多基因疾病
多基因遗传病是遗传信息通过两对以上致病基因的累积效应所致的遗传病，其遗传效应较多地受环境因素的影响。与单基因遗传病相比，多基因遗传病不是只由遗传因素决定，而是遗传因素与环境因素共同起作用。
3、染色体异常疾病
染色体异常疾病，染色体在形态结构或数量上的异常被称为染色体异常，由染色体异常引起的疾病称为染色体病。现已发现染色体病100余种。在临床上可造成流产、先天愚型、先天多发畸形等，在早期自然流产时，50%~60%由染色体异常所致。
第三代试管婴儿PGS/PGD基因筛查诊断技术对大龄夫妇、染色体异常和携带有家庭遗传疾病的人群做出的贡献是巨大的。通过植入前遗传学筛查的胚胎都是优良的胚胎，是父母最优秀基因的结晶，从而达到优生优育。
